ボーンやキーを微調整したい場合の方法はありますでしょうか?
他のソフトウェアではCTRL、SHIFTを押しながらクリックで調整ができますが、同様の操作があれば教えていただきたいです。

画像のようなキーが密集している場所の調整する際などに使用したいです。

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    Guin いただいた内容だけではどのような調整をご希望か分かりませんが、例えばキーの間隔を広げたり、値の変化の差を増減したりするためにはボックス選択+選択範囲のスケールが利用できます:
    グラフ - Spineユーザーガイド ボックス選択

    値の変化の差を増減するにはフェイバーツールも利用できます:
    グラフ - Spineユーザーガイド フェイバーツール

    載せていただいたスクリーンショットがグラフビューのものでしたのでグラフビューの機能を先にご紹介しましたが、ドープシートビューでは調整ボタンを有効にすることで、選択した複数のキーを一度に編集することができます。
    ドープシートビュー - Spineユーザーガイド 調整
    調整の使い方はTipsの方をご覧いただいた方が分かりやすいかもしれません:
    http://ja.esotericsoftware.com/spine-tips#20-float

    また、各種トランスフォームの数値入力欄は、クリックして上下に動かすことで値を変更できますが、その際Shiftキーを押しながら動かすと、値の変化の幅が小さくなり、微調整がしやすくなります。
    ツール - Spineユーザーガイド 数値入力

    もし他の調整方法をお探しでしたら遠慮なくおっしゃってください。